جمعیت پایه گذار
جمعیت غیر پایه گذار
۴۱۰۳۷
۴۹۶
۱۰۲۵۶
۲۰۵۱۳
۲۰۵۲۴
۲-۴-۱- فایل شجره برای تجزیه وتحلیل یک صفته و دوصفته
(( اینجا فقط تکه ای از متن درج شده است. برای خرید متن کامل فایل پایان نامه با فرمت ورد می توانید به سایت feko.ir مراجعه نمایید و کلمه کلیدی مورد نظرتان را جستجو نمایید. ))
جهت تشکیل فایل شجره، از نرم افزار Excel و CFC استفاده شد. فایل شجره در تجزیه یک و یا دوصفتی، باید دارای سه ستون شامل شماره ثبت حیوان، شماره ثبت پدر و شماره ثبت مادر باشد. شماره ثبت بره باید از شماره ثبت پدر و مادر بزرگتر باشد. تعداد کل داده ها ۴۱۰۳۷ بود که برای صفت زندهمانی و طول عمر تهیه و تنظیم شد. در این فایل ۴۹۶ راس قوچ و ۱۰۲۵۶ راس میش وجود داشت.
۲-۴-۲- فایل مشاهدات برای تجزیه و تحلیل یک متغیره
برای صفت زندهمانی فایل مشاهدات به ترتیب، شامل شماره ثبت بره، شماره ثبت پدر، شماره ثبت مادر و عوامل ثابت شامل، گله، جنس، ماه تولد بره، سال تولد بره، نوع تولد بره و رکورد صفت بود.
۲-۴-۳- تجزیه و تحلیل دومتغیره
برای محاسبه همبستگی ژنتیکی بین صفات مختلف، ۲ فایل (شجره و فایل مشاهدات) جهت تجزیه و تحلیل های دوصفته به شرح زیر تهیه شد.
۲-۴-۴- فایل مشاهدات برای تجزیه و تحلیل دوصفته
در این فایل، ستونها به ترتیب عبارت بودند از: شماره ثبت بره، شماره ثبت پدر، شماره ثبت مادر و عوامل ثابت گله، جنس، ماه تولد بره، سال تولد بره، نوع تولد بره و رکورد صفت اول که در زیر آن رکورد صفت دوم قرار میگرفت. در فایل مشاهدات برای صفت زندهمانی و وزن تولد، ابتدا به ستون صفت مربوط به زندهمانی عنوان صفت ۱ و به وزن تولد صفت ۲ داده شد و فایل به صورت دو صفتی آماده شد. در بررسی دوره های سنی زندهمانی، هر دوره به عنوان یک صفت در نظر گرفته شد، مثلاً از تولد تا شیرگیری صفت اول و شیرگیری تا ۶ ماهگی را به عنوان صفت دوم، و به این ترتیب فایل مشاهدات آماده شد.
۲-۵- نرم افزاهای انجام تجزیه ژنتیکی و غیر ژنتیکی
بهمنظور شناسائی اثر عوامل غیر ژنتیکی مؤثر بر صفت طول عمر برهها، یعنی سن برهها در زمان حذف یا مرگ به روز از رویه GLM برنامه آماری SAS بر اساس مدل آماری (۲-۲) استفاده شد:
(۲-۲)
در این مدل مشاهدات مربوط به طول عمر، μ میانگین، Hi اثر ثابت i امین گله (i=1,2,…)، Rj اثر ثابت j امین سال تولد (j=1,..,24)، Mkاثر ثابت k امین ماه تولد (k= 1,..,12)، Sl اثر ثابت l امین جنس بره (l= 1,2)، BTm اثر ثابت m امین تیپ تولد (m = 1,…۴)، Pn اثر ثابت n امین سن مادر بر حسب سال (n= 2,..,7)، متغیر همراه وزن تولد، میانگین وزن تولد و اثر تصادفی باقیمانده میباشند.
تجزیه و تحلیل داده ها برای برآورد پارامترهای ژنتیکی و سایر معیارهای لازم برای محاسبات با بهره گرفتن از از الگوریتم [۲۹]AIREML نرم افزار WOMBAT [Meyer, 2011] انجام شد.
۲-۶- مدلهای مورد استفاده برای تجزیه ژنتیکی طول عمر و اوزان بدن
مدل ۱
y=Xb+Zaa+e
مدل ۲
y=Xb+Zaa+Zcc+e
مدل ۳
Cov(a,m)=0
y=Xb+Zaa+Zmm+e
مدل ۴
